新手艺提升单分子DNA测序水平

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新手艺提升单分子DNA测序水平

宣布时间：2024-06-26 00:00:00泉源：青岛市科学手艺局点击：0 返回列表

科技日报北京6月6日电（记者张梦然）美国格拉德斯通研究所团队开发了两种新的单分子剖析工具，，，，，，，可将所需的DNA量镌汰90%至95%。。。。。该研究效果揭晓在最新一期《自然·遗传学》杂志上，，，，，，，展示了这些工具怎样资助科学家解决他们以前无法回覆的生物学问题。。。。。

单分子剖析的黄金标准要领通常需要至少150000小我私家类细胞，，，，，，，其中包括数百万个单个DNA分子。。。。。这意味着研究职员在只有几千个细胞可用时，，，，，，，基础无法应用这些工具。。。。。

团队此次开发的新工具被称为“单分子实时标记测序”（以下简称SMRT-Tag），，，，，，，它可同时绘制长DNA片断中的碱基序列，，，，，，，以及DNA长度上称为甲基的化学结构位置。。。。。甲基在基因表达中起着要害作用，，，，，，，人们想要相识疾病，，，，，，，就需要相识它们在DNA上的设置方法。。。。。

团队接纳了全新“标记”要领，，，，，，，即使用细菌卵白Tn5将DNA分子切割成更易于处置惩罚的片断，，，，，，，并用进一步剖析所需的化学因素对其举行“标记”。。。。。研究面临的挑战是要让“标记”能恰到利益地将少量DNA剖析成约3000个到5000个碱基对的长片断。。。。。他们用发夹状结构“标记”每个片断的最后，，，，，，，形成便于测序仪读取的长DNA环。。。。。

研究证实，，，，，，，SMRT-Tag要领的性能与此前要领一样好，，，，，，，但使用的DNA量要少得多，，，，，，，相当于在10000个细胞中发明的DNA量。。。。。

接下来，，，，，，，团队将SMRT-Tag与他们之前开发的名为SAMOSA要领团结起来。。。。。SAMOSA可展现基因表达机制怎样轻松会见差别DNA片断。。。。。为了证实全新的“SAMOSA-Tag”工具的能力，，，，，，，他们将其应用于前线腺癌细胞（一些来自患者的初始肿瘤，，，，，，，一些来自已扩散到身体差别位置的肿瘤），，，，，，，这些细胞已被移植并在小鼠体内生长。。。。。该要领乐成展现了染色质可及性差别，，，，，，，这体现了癌症转移的可能要害驱动因素。。。。。

【总编辑圈点】

近年来，，，，，，，科学家借助能以单分子区分率研究人体DNA的手艺，，，，，，，极大地增进了对人类基因组、微生物组和疾病遗传基础的相识。。。。。通过云云详细的DNA视图，，，，，，，人们可看到早期测序手艺无法检测到的遗传变异和结构细节，，，，，，，也可以对此前“无法下手”的少量样本深入剖析。。。。。这一升级到新水平的老手艺，，，，，，，正在成为人类治疗疾病、改善康健的利器。。。。。